Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx11Q91WL6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx11Q91WL6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms