Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nsmce2Q91VT1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nsmce2Q91VT1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms