Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NifkQ91VE6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms