Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hps3Q91VB4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms