Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms