Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fyco1Q8VDC1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fyco1Q8VDC1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms