Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ubxn4Q8VCH8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4Q8VCH8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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