Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnaaf4Q8R368 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnaaf4Q8R368 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms