Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2N2

Utp4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp4Q8R2N2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Utp4Q8R2N2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Utp4Q8R2N2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms