Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Colec12Q8K4Q8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms