Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hecw1Q8K4P8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hecw1Q8K4P8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms