Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdk5rap2Q8K389 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk5rap2Q8K389 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms