Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hacd3Q8K2C9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd3Q8K2C9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd3Q8K2C9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd3Q8K2C9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd3Q8K2C9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hacd3Q8K2C9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms