Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1T0

Tmprss3, Transmembrane protease serine 3, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss3Q8K1T0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmprss3Q8K1T0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmprss3Q8K1T0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms