Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nek9Q8K1R7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nek9Q8K1R7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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