Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms