Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CopaQ8CIE6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CopaQ8CIE6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms