Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms