Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc17Q8CE13 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms