Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc63Q8CDV6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc63Q8CDV6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms