Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc9Q8CDN9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc9Q8CDN9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc9Q8CDN9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc9Q8CDN9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms