Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nrip1Q8CBD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nrip1Q8CBD1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms