Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sfrp1Q8C4U3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp1Q8C4U3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms