Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc90bQ8C3X2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc90bQ8C3X2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms