Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ska3Q8C263 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska3Q8C263 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms