Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ube3dQ8BX13 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ube3dQ8BX13 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube3dQ8BX13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Ube3dQ8BX13 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube3dQ8BX13 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ube3dQ8BX13 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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