Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sdhaf4Q8BTE0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms