Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Tspan12Q8BKT6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan12Q8BKT6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms