Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms