Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGY9

Slc5a7, High affinity choline transporter 1, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a7Q8BGY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Slc5a7Q8BGY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc5a7Q8BGY9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Slc5a7Q8BGY9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Slc5a7Q8BGY9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Slc5a7Q8BGY9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Slc5a7Q8BGY9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slc5a7Q8BGY9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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