Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trmt12Q8BG71 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms