Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-M10.2Q85ZW9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2-M10.2Q85ZW9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms