Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M10.4Q85ZW8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms