Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmem39bQ810L4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmem39bQ810L4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms