Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cracr2bQ80ZJ8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms