Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pkhd1l1Q80ZA4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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