Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Zbed4Q80WQ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Zbed4Q80WQ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms