Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Pcsk9Q80W65 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pcsk9Q80W65 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pcsk9Q80W65 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms