Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ntf4Q80VU4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ntf4Q80VU4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms