Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cep170bQ80U49 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep170bQ80U49 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms