Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdc42bpbQ7TT50 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdc42bpbQ7TT50 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms