Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lamp3Q7TST5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lamp3Q7TST5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms