Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ube2q1Q7TSS2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2q1Q7TSS2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms