Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Actn1Q7TPR4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Actn1Q7TPR4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms