Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ShprhQ7TPQ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ShprhQ7TPQ3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms