Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf139Q7TMV1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms