Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms