Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Topbp1Q6ZQF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Topbp1Q6ZQF0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms