Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ino80Q6ZPV2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80Q6ZPV2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms