Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opn5Q6VZZ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms